1979年9月，我院与日本学术振兴会（JSPS）签署了学术交流备忘录，自此两国结束了战后学术交流中断的历史，从半官半民的层次开始了长期交流与合作，交流范围涉及自然科学研究的整个领域。30年来，互访学者人数已有约3000人，双方在宇宙线探测、加速器、天文、核聚变等领域的合作取得了令人瞩目的成果。