1993年，中国科学院率先并持续开展对研究所的年度定量评价。1998年以来，改革科技评价制度，建立和完善了综合质量评估、政策导向评价与基础指标测评相结合的科技评价体系，建立了评价结果与研究所资源配置及法定代表人年薪挂钩的机制。2005年，开展了研究所综合质量评估，5年评估一次，2~3年间微调，评价结果分类分档，并与预算经费和个人首付挂钩。2006年，建立研究所自评交流制度，经过全面研究和梳理国内外科技评价的理论与实践，构建科技评价体系框架。