与区域创新体系紧密结合，2006年起，中国科学院陆续与广东、福建、上海、江苏、浙江、山东、天津及深圳、厦门、宁波、上海、苏州、青岛、烟台、天津等地共建深圳先进研究院、厦门城市环境研究所、宁波材料技术与工程研究所等多个研究所。