1951年3月5日，为了加强科学院对工业、农业、卫生、教育、国防各部门的联系，以便计划与指导全国的科学研究事业，周恩来签发政务院关于科学研究工作的指示。《指示》中规定：（1）各部门举行的各种专业会议，凡与科学研究有关者，应邀请科学院派专人参加。（2）各部门所领导的科学研究机构，在制订研究计划时应与科学院取得联系，并定期将研究情况副本送至科学院。科学院应尽量给予各部门研究机构业务上技术上的指导与协助。（3）科学院应注意有系统地宣传中国和外国科学研究的成果，并建议各生产部门和教育部门采择应用，或建议有关部门共同组织对于这些成果的进一步的研究。各部门在采用和推广科学新成就，改正违背科学的旧习惯的问题上，应与科学院积极合作。（4）科学院应注意有系统地调查各生产部门对于科学研究的需要，并力求使自己的和全国科学研究人员的工作计划适应这些需要。为了这个目的，科学院得在必要时召集全国科学研究人员会议，宣布全国科学研究工作的任务，并要求各有关部门的协助。