第五任院长：路甬祥，1997年7月—至今
　　副院长：严义埙，2000年离任
　　　　　　许智宏，2003年1月离任
　　　　　　陈宜瑜，2003年12月离任
　　　　　　白春礼，2004年12月—至今任常务副院长
　　　　　　杨柏龄，1999年5月—2003年12月
　　　　　　江绵恒，1999年11月—至今
　　　　　　陈　竺，2000年10月—2007年6月
　　　　　　施尔畏，2004年1月—至今
　　　　　　李家洋，2004年1月—至今
　　　　　　李静海，2004年2月—至今
　　　　　　曹健林，2005年1月—2006年9月
　　　　　　詹文龙，2008年1月—至今
　　　　　　丁仲礼，2008年1月—至今
　　　　　　阴和俊，2008年1月—至今